Farklı etki türleri nedeniyle, bakteriyel ve viral enfeksiyonlar da farklı şekilde tedavi edilir. Antibiyotikler bakterilere karşı toleranslıdır. Antibiyotik ajanlar hücreyi çeşitli hayati anahtarlama noktalarına hedefler ve böylece öldürür. Bununla birlikte, antibiyotikler insan hücrelerine yönelik olmadığından, viral olarak enfekte olmuş konakçı hücreler saldıramaz.Virüslerin neden olduğu hastalıklar için antiviraller vardır. Virüslerin penetrasyonu ve çoğalmasıyla savaşmaları gerekir. Aktif bileşenler ayrıca virüslerin bağlanma yeteneği üzerinde engelleyici bir etkiye sahiptir.